Multipl Skleroz Hastalığının kandan tanı ve izlemine yönelik RNA temelli biyobelirteç teknolojilerinin geliştirilmesi

PROJE HEDEFLERİ

Multiple Skleroz (MS), genç ve orta yaş grubunda en sık görülen ve nörolojik bozukluklara yol açan merkezi sinir sisteminin (MSS) kronik inflamatuvar, demiyelinizan ve nörodejeneratif otoimmün bir hastalığıdır. MS, genetik ve çevresel faktörler arasındaki karmaşık etkileşimlerden kaynaklanır, ancak hastalık gelişimine yol açan kesin nedenler ve moleküler yolaklar hala kesin olarak bilinmemektedir. Son yıllarda kodlayıcı olmayan RNA'lar (ncRNA'lar) hücre büyümesi, farklılaşması, bağışıklık ve inflamasyon gibi farklı biyolojik süreçlerin kilit düzenleyicileri olarak ortaya çıkmakta ve bunların MS patogenezinin altında yatan mekanizmalarda önemli bir rol oynadıkları ileri sürülmektedir. Projede;

1. İn siliko yöntemler ile NCBI GEO veri tabanına yüklenen farklı veri setlerinin (PBMC-Total kan numuneleri mikroarray verileri) analizi sonucu ön plana çıkan miRNA öncelikli olacak şekilde (hsa-mir-142-3p), farklı kategorilerde MS tanısı almış bireylerden, sağlıklı gönüllüler ve oto-immün hastalığa ve ayrıca nörolojik diğer hastalıklara sahip bireylerle karşılaştırmalı olarak  non-invaziv teknikler ile total kan ve PBMC numunelerinden diagnostik ve prognostik kullanımına yönelik hedef moleküler biyobelirteçlerin ve ayrıca yeni belirlenebilecek biyobelirteçlerin transkriptomik yöntemlerle belirlenmesi hedeflenmektedir.   
2. Hedef olarak belirlediğimiz ve potansiyel yeni hedef olarak tespit edebileceğimiz mRNA’ın validasyonlarının sağlanabilmesi ve potansiyel mRNA biyobelirteç adaylarının da tespitinin yapılabilmesi için mRNA dizilemesi  yapılacaktır. Belirlenen miRNA-mRNA hedef biyobelirteçlerin ve yeni belirlenebilecek biyobelirteçlerin tanımlanması, ayrıca belirlenecek İkinci kohort hastalarda QPCR ile validasyonu gerçekleştirilecektir.
3. Projede tüm bu çalışmaların sonucunda belirlenmiş ve doğrulanmış olan belirteçlerin tespitine yönelik klinikte kullanılabilir bir teknolojinin geliştirilmesi hedeflenmektedir